Los programas de posgrado ofrecidos por la Universidad Nacional de Colombia, buscan desarrollar un conocimiento interdisciplinario sobre la Amazonia, siendo respetuoso con las formas de conocimiento indígena y local, del mismo modo que aspira a aprender de ellos. También es consciente de que la Panamazonia es multinacional y se articula de maneras complejas con los procesos de globalización.

La sede Amazonia oferta programas de posgrados en Estudios Amazónicos desde el año 2001, con el fin de contribuir al conocimiento sobre la región al tiempo de promover el fortalecimiento de comunidades académicas locales y regionales. La Universidad se encuentra localizada en Leticia, una ciudad tri-fronteriza y punto de encuentro de Brasil, Colombia y Perú en la ribera del Amazonas.